Enstitümüz Öğretim Üyelerinden Behçet Uğur Töreyin, Lütfiye Durak-Ata ve Araş Gör. Dr. Abdulkerim Çapar'ın ve yazarları arasında olduğu 'A whole-slide image grading benchmark and tissue classification for cervical cancer precursor lesions with inter-observer variability' başlıklı makale 'Medical & Biological Engineering & Computing' dergisinde 2021 yılında yayınlanmıştır.

DOI: https://doi.org/10.1007/s11517-021-02388-w

Cite:
Albayrak, A., Akhan, A.U., Calik, N., Capar, A., Bilgin, G., Toreyin, B.U., Muezzinoglu, B., Turkmen, I. and Durak-Ata, L., 2021. A whole-slide image grading benchmark and tissue classification for cervical cancer precursor lesions with inter-observer variability. Medical & Biological Engineering & Computing, 59(7), pp.1545-1561.

Abstract:
The cervical cancer developing from the precancerous lesions caused by the human papillomavirus (HPV) has been one of the preventable cancers with the help of periodic screening. Cervical intraepithelial neoplasia (CIN) and squamous intraepithelial lesion (SIL) are two types of grading conventions widely accepted by pathologists. On the other hand, inter-observer variability is an important issue for final diagnosis. In this paper, a whole-slide image grading benchmark for cervical cancer precursor lesions is created and the "Uterine Cervical Cancer Database" introduced in this article is the first publicly available cervical tissue microscopy image dataset. In addition, a morphological feature representing the angle between the basal membrane (BM) and the major axis of each nucleus in the tissue is proposed. The presence of papillae of the cervical epithelium and overlapping cell problems are also discussed. Besides that, the inter-observer variability is also evaluated by thorough comparisons among decisions of pathologists, as well as the final diagnosis

A whole-slide image grading benchmark-1

İTÜ Bilişim Enstitüsü

bilisim-anasayfa-hakkimizda

İTÜ Bilişim Enstitüsü, Bilişim Uygulamaları, Bilgisayar Bilimleri, Hesaplamalı Bilim ve Mühendislik ile İletişim Sistemleri Anabilim Dallarında aşağıda yer alan programlarda lisansüstü düzeyde eğitimler veren, bu alanlarda temel ve uygulamalı araştırmalar yapan bir birimdir.

Enstitü öğretim üyeleri ile öğrencileri, elektromanyetik alanlar, haberleşme sistemleri/regülasyonları, hesaplamalı malzeme tasarımı, hesaplamalı kimya/biyoloji, kriptografi, işaret/veri işleme/görselleştirme, büyük veri yönetimi, iklim ve okyanus bilimleri, termodinamik modelleme, haberleşme ağları ve moleküler enformatik alanlarında ulusal ve uluslar arası kuruluşlarca desteklenen araştırmalar yürütmektedir.

Enstitü öğretim üyeleri ve öğrencileri tarafından alınan ödüllerden bazıları:

  • En Etkili Bilim İnsanları Listesi; Doç.Dr. B. Uğur Töreyin (Dr. John PA Ioannidis, K. W. Boyack ve J. Baas’ın PLOS Biology dergisinde yayımlanan makalesi)
  • 2020 Uluslararası Öğrenciler Proje Yarışmasında, Fen Bilimleri kategorisinde en iyi proje ödülü, Beltus Nkwawir Wiysobunri
  • Dr. Abdulkerim Çapar'ın da kurucu ortakları arasında yer aldığı Argenit firması, İTÜ ARI Teknokent’in “Ulusal-Uluslararası Destekler” Birincilik ödülünü almıştır.
  • TÜBİTAK 2242 Öncelikli Alanlarda Üniversite Öğrencileri Proje Yarışması: İstanbul bölgesi birinciliği - Ahmet Burak Özyurt
  • ICAT'18 Konferansında En İyi Sunum Ödülü: Sena Efsun Cebeci, 2018
  • Tübitak Teşvik Ödülü; 2016 Doç.Dr. Adem Tekin
  • Amerikan Isıtma Soğutma ve İklimlendirme Derneği tarafından “Teknik Makale” ve “Willis H. Carrier” Ödülü; 2016 Yrd.Doç.Dr. H. Salih Erden
  • Bilim Kahramanları Derneği Yılın Genç Bilim İnsanı Ödülü; 2016 Doç.Dr. B. Uğur Töreyin PRACEdays 2016 konferansında En İyi Poster Ödülü; Samet Demir
  • İTÜ En Başarılı Tez Ödülü; 2016 Hatice Gökcan

Enstitü bünyesinde, Devlet Planlama Teşkilatı desteğiyle kurulan bir Yüksek Başarımlı Hesaplama Laboratuvarı da bulunmaktadır.